Капитан Уиллард получает секретное задание в разгар Вьетнамской войны. Его цель — подняться вверх по реке, пересечь границу и проникнуть в камбоджийские джунгли. Там скрывается полковник Курц, некогда образцовый офицер, а теперь командующий собственной армией в глуши. Курц отрезан от командования, создав вокруг себя культ личности, основанный на страхе и мистике.
Уиллард присоединяется к экипажу патрульного катера. Маленькое судно становится его миром на время долгого и опасного путешествия. Река превращается в дорогу в самое сердце тьмы. Капитан изучает досье на Курца, пытаясь понять, как герой войны стал мишенью для своего же командования.
По мере продвижения вглубь джунглей экипаж становится свидетелем абсурдных и пугающих сцен. Война предстаёт в виде хаотичного спектакля, лишённого всякого смысла. Столкновения с противником чередуются с встречами, которые сложно объяснить логически. Постепенно граница между порядком и хаосом, между цивилизацией и дикостью начинает стираться.
Окружающее безумие влияет на психику каждого на борту. Путешествие становится не просто физическим перемещением, но и внутренним падением в бездну. Мысли Уилларда всё чаще возвращаются к фигуре Курца. Он начинает задаваться вопросом, действительно ли полковник сошёл с ума, или же он просто увидел истинное лицо войны, которое другие отказываются признавать.
Чем ближе цель, тем больше капитан чувствует странную связь с человеком, которого ему приказано уничтожить. Джунгли, река, постоянная угроза — всё это меняет его восприятие. Задача, изначально казавшаяся чёткой военной операцией, обретает философские и мрачные оттенки. В финале пути его ждёт встреча, которая навсегда изменит понимание природы насилия, власти и человеческой души в экстремальных условиях.